Genome Property Definition Page
| Accession | GenProp0913 |
| Name | E. coli O-antigen monomer biosynthesis clusters |
| Type | METAPATH |
| Description | blast database at /usr/local/projects/GSTEC/BLAST/ gstec01 : 1.2741 : O2/H4 : GenProp0963 gstec02 : 97.0246 : O5/H- gstec03 : 5.0588 : O8/H- gstec04 : 97.0259 : O11/H- gstec05 : H30 : O26/H11 gstec06 : 95.0941 : O45/H2 gstec07 : 1.2264 : O76/H- gstec08 : 97.0264 : O88/H25 gstec09 : 96.0497 : O91/H21 gstec10 : 99.0741 : O91/H- gstec11 : 3.2608 : O103/H2 : GenProp0953 gstec12 : 93.0624 : O103/H6 : GenProp0953 gstec13 : 4.0522 : O111/H- : GenProp0949 gstec14 : JB1-95 : O111/H- : GenProp0949 gstec15 : 96.154 : O113/H12 gstec16 : 5.0959 : O121/H19 gstec17 : 9.1649 : O2/H- : GenProp0963 gstec18 : 9.0111 : O128/H2 gstec19 : 4.0967 : O145/H2 gstec20 : 2.3916 : O147/H- gstec21 : 3.3884 : O153/H- gstec22 : 2.4168 : O157/H12 gstec23 : 3.2303 : O157/H16 gstec24 : 3003 : O157/H45 gstec25 : TW07793 : O157/H39 gstec26 : B41 : O101/NHM gstec27 : 900105 (10e) : O26/H11 |
| Parent Property | GenProp0966: E. coli O-antigen biosynthesis |
Components
| Step Name | Step Num | Required | Evidence (Method) | Evidence Go Terms |
|---|---|---|---|---|
| any O-antigen monomer system | ANY | YES | GenProp0953 (GENPROP): O103(Ec) antigen biosynthesis GenProp0932 (GENPROP): O104(Ec) antigen biosynthesis GenProp0949 (GENPROP): O111(Ec) antigen biosynthesis GenProp0963 (GENPROP): O2(Ec) antigen biosynthesis GenProp0974 (GENPROP): O26(Ec) antigen biosynthesis GenProp0947 (GENPROP): O55(Ec) antigen biosynthesis GenProp1018 (GENPROP): O8(Ec) antigen biosynthesis GenProp1019 (GENPROP): O9(Ec) antigen biosynthesis GenProp1014 (GENPROP): O5(Ec) antigen biosynthesis GenProp1020 (GENPROP): O91(Ec) antigen biosynthesis GenProp1023 (GENPROP): O157(Ec) antigen biosynthesis GenProp1030 (GENPROP): O88(Ec) antigen biosynthesis GenProp1031 (GENPROP): O76(Ec) antigen biosynthesis GenProp1035 (GENPROP): O113(Ec) antigen biosynthesis GenProp1036 (GENPROP): O11(Ec) antigen biosynthesis GenProp1038 (GENPROP): O121(Ec) antigen biosynthesis GenProp1042 (GENPROP): O128(Ec) antigen biosynthesis GenProp1043 (GENPROP): O145(Ec) antigen biosynthesis GenProp1045 (GENPROP): O147(Ec) antigen biosynthesis GenProp1046 (GENPROP): O153(Ec)-antigen biosynthesis GenProp1047 (GENPROP): O101(Ec) antigen biosynthesis GenProp1049 (GENPROP): O1(Ec) antigen biosynthesis |
Parent Properties
| Accession | Name |
|---|---|
| GenProp0966 | E. coli O-antigen biosynthesis |
Child Properties
| Accession | Name |
|---|---|
| GenProp0932 | O104(Ec) antigen biosynthesis |
| GenProp0947 | O55(Ec) antigen biosynthesis |
| GenProp0949 | O111(Ec) antigen biosynthesis |
| GenProp0953 | O103(Ec) antigen biosynthesis |
| GenProp0963 | O2(Ec) antigen biosynthesis |
| GenProp1014 | O5(Ec) antigen biosynthesis |
| GenProp1018 | O8(Ec) antigen biosynthesis |
| GenProp1042 | O128(Ec) antigen biosynthesis |